1980年，轻工部、纺织部作为行业环保管理的试点筹建了“浙江省轻工业厅环境保护管理站”（后更名为“浙江省轻纺工业环境保护管理站”），隶属于原浙江省轻工业厅。随着我国体制改革的深入发展，轻工部、纺织部、浙江省轻工业厅都发生了职能转变。根据轻工、纺织部的意见，浙江省轻纺工业环保站的业务发展着重于行业的环保技术服务，于1987年以浙江省轻纺工业环境保护管理站资产注册成立了浙江省轻工环保设计所（现名浙江省工业环保设计研究院）。浙江省轻纺工业环境保护管理站与浙江省工业环保设计研究院一直以一班人马、二块牌子进行环保技术服务。2005年底，由于原省轻工业厅的改制需要，在浙江省政府的支持下将浙江省轻纺工业环境保护管理站（包括浙江省工业环保设计研究院）成建制并入浙江工商大学。

浙江省工业环保设计研究院是浙江省最早从事环境污染防治工程专项设计和建设项目环境影响评价的单位之一。1987年取得浙江省建设厅核发的废水治理工程乙级设计资质，1997年获得国家环境工程设计专项（废水甲级）资质，凭借甲级资质，我院可在全国范围内承接废水治理工程设计。2001年获环境污染治理设施运营资质证书（国环运营证0454，废水甲级）。1985年开始从事建设项目环境影响评价工作，早在1987年便获取浙江省环保局核发的环评资质证书（浙环评字0107号），1990年省环保局对全省环评单位进行考核换证，我院获浙环评证乙字第001号环评资质证书，1999年由国家环保总局核发换证为国环评乙字第2007号,2008年升级为国环评甲字第2007号。